Banyak sekolah masih menerpakan kemah tiga hari setelah pelaksanaan MOS. Namun, tahun ini tidak untuk SMK Muhammadiyah Pekalongan. Dengan format baru dalam pelaksanaan MOS tahun ajaran 2010/2011 ini ingin mendekatkan siswa -siswi lebih disiplin dan relogius. Lebih mengenal mendalam tentang SMK-nya, merawat dan menjadikan hijau sekolahnya. Serta tidak lupa akan rutinitas ibadah.

MOS yang dilaksankan selama empat hari yang dimulai hari senin hingga kamis tanpa warna - warni perploncoan, paksaan, hukuman dan eksploitasi lainnya. Kreatifitas siswa baru tetap dibangun secara positif dengan cara yang berbeda. Bertemu dengan pemerhati dunia pendidikan, kesehatan dan kepolisian. Tidak lupa, kegiatan kerohanian yang menekanan kedisiplian ibadah dan waktu.

Acara yang menjadi ajang puncak adalah pelaksanaan One Man One Tree yang dilakukan di sekolah dan lingkungan sekitarnya. Bekerja sama dengan Dinas Lingkungan Hidup dan Perhutani menanam 400 bibit tanaman. Serta dilanjutkan dengan ESQ For Teen yang memberikan pengembangan jiwa bagi generasi muda. Tampil dengan didukung multimedia di aula SMK Muhammadiyah pelaksanaan yang baru bagi siswa - siswi  SMK Muhammadiyah.

Menindaklanjuti kebutuhan yang bertambah pada tahun ajaran baru 2010/2011 pada beberapa bagian  membutuhkan beberapa tenaga pengajar, yaitu :

1. Teknik Mesin 3 Orang  ( S1 )

2. Seni Musik 1 Orang  ( S1 )

3. Bimbingan dan Konseling / Psikologi 1 Orang ( S1 )

MOS ( Masa Orientasi Sekolah) ituah yang menjadi pegangan SMK Muhammadiyah Pekalongan mengadakan acara rutin di awal tahun ajaran baru. Masa orientasi ini tidak saja diberikan kepada siswa kelas satu, tetapi diberikan kepada seluruh siswa yang memasuki tahun ajaran baru ini. Dan ada yang beda dengan MOS yang dilaksanakan setiap tahunnya ini. Tentunya BEDA dengan sekolah lain. Apa yang BEDA MOS SMK Muhammadiyah Pekalongan?

BEDA yang terlihat adalah menegakkan budaya disiplin tanpa harus dengan hukuman yang nyeleneh seperti yang dilakukan Panitia MOS di sekolah lain, seperti membawa makanan ringan bergambar macam dll. Displin untuk menepati waktu dan disiplin religius (sholat jamaah dan tadarus). Materi yang diberikan pun tidak hanya hal tentang belajar dan sekolah, tetapi siswa diperkenalkan  tentang Teknologi Informasi, Bersuci, beribadah yang baik, kemah taaruf di ubah menjadi bermalam untuk melaksankan sholat lail (tahajud) dan ESQ for Teen. Diharapkan dengan ini siswa dapat tumbuh dan belajar di SMK Muhammadiyah ini lebih terarah dengan kedisiplinan dan kereligiusannya.

Sementara, kelas 2 dan 3 juga melaksanakan MOS dengan materi yang berbeda dengan kelas satu. Selain mengevaluasi hasil pembelajaran tahun sebelumnya. Kegiatan yang sesuai dengan kelas dua adalah persiapan magang industri serta bagaimana melaksankan magang industri. Sedangkan kelas 3 difokuskan untuk memberi motivasi untuk persiapan Ujian Nasional kedepan serta bagaimana menatap masa depan dengan memberikan gambaran setelah lulus dari SMK : Wirausaha, Bekerja atau kuliah.